Институт физиологии СО РАМН продолжает выполнять функции ведущего учреждения, координирующего физиологические исследования в Сибири и на Дальнем Востоке. С момента создания в 1983 г. Научного Совета АМН СССР по медицинским проблемам Сибири, Дальнего Востока и Крайнего Севера Институт физиологии осуществлял координацию научных исследований НИУ и ВУЗов Сибири и Дальнего Востока по двум проблемам союзного значения в качестве головного учреждения Проблемных комиссий «Общая и прикладная физиология» и «Возрастная и функциональная морфология».В рамках Научного Совета АН и АМН СССР по проблемам прикладной физиологии человека Институт был головным учреждением ПК «Экологическая физиология человека в северных регионах».
Институт являлся также головным учреждением по координации исследований в рамках региональной программы АМН СССР «Медико-биологические проблемы вахтовой организации труда в районах нового промышленного освоения» («Вахта»).
В настоящее время Институт физиологии — головное учреждение ПК 56.02 «Нормальная и патологическая физиология» Научного совета РАМН и МЗ РФ N56 по медицинским проблемам Сибири, Дальнего Востока и Крайнего Севера.
