Временная лаборатория геномной медицины (по гранту РНФ)

kovalenko3

Заведующий временной лабораторией
доктор биологических наук
Коваленко Сергей Петрович
электронная почта: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

 

Сотрудники

  ФИО Должность, ученая степень, ученое звание Телефон Адрес электронной почты
1 Коваленко Сергей Петрович
Заведующий временной лабораторией 
доктор биологических наук
  Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
2 Анисименко Максим Сергеевич
Младший научный сотрудник
  Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
3 Бердюгина Дарья Алексеевна Аспирантка   Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
4 Гаранин Александр Юрьевич
Лаборант
 
5 Буторина Анна Владимировна
Лаборант
 

 

Основные направления исследований

  • Генетические основы нейродегенеративных заболеваний человека.
  • Анализ экспрессии генов, связанных с нейродегенеративными заболеваниями.

Исследования проходят в рамках гранта РНФ 2016-2018 гг. «Структурные особенности гена SIRT1 как основа для выбора персонализированной лекарственной терапии депрессии» (руководитель гранта – академик РАН Л.И. Афтанас).

 

Важнейшие научные результаты

  • Проведено масштабное исследование встречаемости полиморфных вариантов гена SIRT1 на выборке добровольцев города Новосибирска, обнаружены не описанные ранее варианты.
  • Проведен анализ экспрессии генов-кандидатов, вовлеченных в метаболизм амилоида-бета, в мозговых структурах на модели спорадической болезни Альцгеймера (линия крыс OXYS).

 

Избранные публикации

  • Khafizov K., Ivanov M. V., Glazova O. V., Kovalenko S.P. Computational approaches to study the effects of small genomic variations // The Journal of Molecular Modeling. – 2015. – V. 21, No. 10. – P. 251. 
  • Anisimenko M. S., Kozyakov A. E., Paul G. A., Kovalenko S. P. The frequency of the BLM p.Q548X (c.1642C>T) mutation in breast cancer patients from Russia is no higher than in the general population // Breast Cancer Research and Treatmen. – 2014. – V. 148, No. 3. – P. 689-690.
  • Pisareva E., Gutkina N., Kovalenko S., Kuehnapfel S., Hartmann A., Heinzerling L., Schneider-Stock R., Lyubchenko L., Shamanin V. A. Sensitive allele-specific real-time PCR test for mutations in BRAF codon V600 in skin melanoma // Melanoma Research. – 2014. – V. 24, No. 4. – P. 322-333.
  • Anisimenko M. S., Mitrofanov D. V., Chasovnikova O. B., Voevoda M. I., Kovalenko S. P. BRCA1 gene mutations frequency estimation by allele-specific real-time PCR of pooled genomic DNA samples // Breast. – 2013. – V. 22, № 4. – P. 532-536.
  • Iyevleva A. G., Suspitsin E. N., Kroeze K., Gorodnova T. V., Sokolenko A. P., Buslov K. G., Voskresenskiy D. A., Togo A. V., Kovalenko S. P., Stoep N. V., Devilee P., Imyanitov E. N. Non-founder BRCA1 mutations in Russian breast cancer patients // Cancer Letters. – 2010. – V. 298, No. 2. – P. 258-263.

 

Основное оборудование

 №№

п/п

Наименование оборудования

Фирма-производитель

Страна происхождения

1 Cистема для проведения ПЦР в режиме реального времени Light Cycler 480

Roche Applied Science

США
2

Cистема очистки воды MilliporeDirect-Q3 UV

Millipore Франция
3 Вакуумный концентратор Concentrator Plus Eppendorf Германия 
4 Секвенатор PGM IonTorrent

Thermo Fisher

США
5 Автоматический  секвенатор для проведения классического секвенирования фрагментов ДНК по методу Сэнгера GeneticAnalyzerABI 3500 Applied Biosystems Instruments США
6

Боксы ламинарные 2-класс защиты

Ламинарные системы США